Nos termos do Artigo 26.º dos Estatutos do ISAG (colocar hiperligação para o documento que estará nos Documentos Institucionais) Conselho Disciplinar é composto pelos líderes do Conselho de Direção, do Conselho Técnico-Científico e do Conselho Pedagógico. Sob a presidência do líder do Conselho de Direção, este órgão trata de questões disciplinares dentro da instituição. Para evitar conflitos de interesse, em casos envolvendo membros do próprio Conselho Disciplinar, a Entidade Instituidora designa um substituto de outros órgãos de gestão. As decisões são tomadas por consenso ou maioria simples, com o Presidente tendo voto de qualidade. Os mandatos dos membros no Conselho Disciplinar coincidem com seus mandatos nos órgãos de origem.